A Tématerületi Kiválósági Program legfontosabb célja az akadémiai kutatóintézetek, a felsőoktatási intézmények és az állam által alapított kutatóintézetek hatékony és eredményes szakmai munkájának megalapozása.
Biztosítani kívánjuk a rendelkezésre álló pénzügyi keret szakmai kiválóságra építő célzott forrásallokációját, a kutatási együttműködések fokozását, az intézmények számára a kiszámítható és fenntartható finanszírozási rendszer keretfeltételeit.